スポーツの名門男子校ジニーハイスクールに、髪を短く切って男子に扮した女学生ク・ジェヒが転校してくる。ジェヒは、アメリカでの入院生活中、世界ジュニア陸上選手権の走り高跳び金メダリスト カン・テジュンに魅了され、彼に会うために韓国へやってきたのだ。運よくテジュンと同じクラス、そして同じ寮の同室になれたジェヒは舞い上がるが、テジュンは冷たく突き放そうとする。なんとテジュンは、陸上競技を引退しようとしていたのだ！

サッカーの試合中にタックルされ気絶したジェヒは保健室に運ばれ、そこで校医のミヌに女子であることを見抜かれてしまう。しかしジェヒは怪我に苦しむテジュンの力になりたい一心でこの学校に来たことを熱弁し、しばらくの猶予を与えられる。そんな中、学校では寮対抗の体育祭が開催されるのだが、テジュンは優勝に不可欠な走り高跳びをボイコットしてしまう。ジェヒはテジュンの穴を埋め、寮を優勝に導くため、最もハードなマラソンに立候補する。

テジュンが酔ってジェヒにキスした写真が校内でばら撒かれ、ヒョンジェがその写真をネタにテジュンを挑発し一触即発となるが、アメリカ帰りのジェヒはキスなんて挨拶代わりだと、隣にいたウンギョルの頬にキスをしてみせることでその場を収める。その週末、ジェヒはウンギョル達と寮長スンニの母親が営む海辺のペンションに遊びにいくのだが、実家に帰りたくないテジュンもひょんなことからそのペンションを訪れる。

ペンションでの週末を終え、学校に戻るジェヒのもとにとんでもないメールが飛び込んでくる。アメリカにいるはずの義兄が明日会いに来るというのだ。翌日、かつらをかぶったジェヒは、ハンナの制服を拝借し、セリン女子高生になりすまして兄と再会する。しかし、一緒に買い物に出かけたデパートで運悪くハンナに遭遇した上、そのデパートで開催中のテジュンのサイン会に並んでしまう。

ジェヒの気持ちを知り、陸上競技への復帰を決心したテジュンは退部届けを取り下げようとするが、コーチはそう簡単に許してはくれない。テジュンは体育館の掃除をしながら、ひたむきに自主練習を続けることにする。そんな姿を見たコーチは、テジュンに再入部へのある条件を提示する。一方、ジェヒは何者かに体操着を水浸しにされ、さらにテジュンを装ったメールによって高飛び込み用のプールに呼び出される。

校内で行われた陸上大会の地区予選で競技に復帰を果たしたテジュン。ジェヒは心から復帰を喜ぶが、テジュンはコーチとの約束が果たせず、相変わらず陸上部には戻ることができずにいた。見かねたジェヒは、寮長で陸上部の部長でもあるスンニに持ちかけられた、学園祭のメインイベント女装ミスコン大会"ミスジニー"に出場することを条件に、テジュンの再入部をコーチに掛け合うよう依頼する。

寮の配管工事のため、学生達はしばらくの間3人で1部屋を使うことになる。なんとしてもジェヒと同じ部屋を使いたいウンギョルは、先輩に必死に頼み込んでジェヒ達の部屋に入り込み、夢の様な同居生活を始める。一方、同じ部屋で仲良く過ごすジェヒとウンギョルを見て、ついツンケンした態度をとってしまうテジュンは自分の中のある感情に気づき始める･･･。

ジェヒとテジュンは陸上部の強化合宿に参加するためキャンプ場を訪れる。
一方、寮に一人ぼっちになってしまったウンギョルも、ジェヒに会うためにキャンプ場に押しかける。その後、恒例行事のサバイバルゲームが始まり、敗者がパンツ姿でキャンプ場を１周することになってしまう。テジュンはジェヒを守るために全力で戦場を駆け抜ける。そんな野外訓練の夜。2人は小さなテントで寝ることに！しかし、そんな2人の元に突然ハンナが現れる。

またしてもジェヒの前に新たな訪問者が現れる。ジェヒの正体を知る、カリスマフォトグラファーのジョニーだ。なんとジョニーはジェヒの幼馴染で、初恋相手だったのだ。ジョニーとジェヒの慣れたスキンシップに嫉妬を隠し切れないテジュン。そんな中、ジェヒがジョニーとソウル観光に行くと知ったテジュンは、強引にガイド役に立候補し、更にはジェヒのお願いでジョニーの撮影モデルを引き受けてしまう。そんなテジュンの行動に、ジョニーはある疑いを持ち始める。

テジュンは日に日に募るジェヒへの想いを伝えるため、インタビューで「韓国で跳ぶ姿を見せたい人がいる」と衝撃告白をする。このニュースを聞いたジェヒは、ハンナの為にカナダ留学を断ったと勘違いし、テジュンと口論になってしまう。その後、落ち込んだジェヒはジョニーに誘われ、ドレス姿で写真展に参加するのだが、偶然居合わせたハンナにその姿を見られてしまう。テジュンの機転でなんとかその場をやり過ごしたジェヒだったが、ハンナはジェヒが女だと確信しつつあった･･･。

生放送でテジュンとの交際を明かしたハンナの衝撃告白で、公認カップルになってしまった2人。すぐさまハンナの元に駆けつけるテジュンだったが、交際を解消すればジェヒの秘密も公表すると言われ、黙認を迫られる。ジェヒを守ろうとするテジュンは、ジェヒの秘密を公表しないことを条件に、ハンナとの交際を受け入れる。一方、交際を始めた2人の姿に涙を流すジェヒを見てしまったウンギョルは、ジェヒの想いに気づかないテジュンに怒りをぶつける。

ついにジェヒへの想いを告白したウンギョル。冗談だと思っていたウンギョルの言葉から本心を感じたジェヒは動揺し、2人の間に気まずさが残る。ウンギョルの告白を知ったテジュンも落ち着かない。ウンギョルへの申し訳なさと、テジュンへのドキドキで混乱したジェヒは、ミヌに恋愛相談を持ちかける。ミヌはジェヒにタイムリミットが近いことを告げ、週末田舎で行う一泊二日のボランティア活動に3人を参加させ、気持ちを整理させようとする。

自分の感情に素直になることを決意するテジュンだったが、ジェヒを失うかもしれないという不安から、告白できずにいた。一方、ジェヒは偶然学校を訪問していたテジュンの父親に出会う。テジュンを心配する父親の愛を感じ、テジュンと父親との和解を試みるが、固く閉ざされたテジュンの心は簡単に開かない。そんな中、全国大会を前にテジュンの周りで不可解な事件が起こるようになる。おかしく思ったジェヒはある人物に疑いを持つが...。

テジュンの父親が倒れたという連絡を受けて、しぶるテジュンを強引に病院に連れて行くジェヒ。過去の記憶から抜け出せないテジュンは、父親に二度と病院には来ないと告げ、立ち去る。その後、テジュンは原因不明のスランプに陥り、大会を前にして記録が伸びなくなってしまう。ジェヒは父親との関係が原因だと察し、テジュンのために"思い出のデートコース"を用意して街へ連れ出す。

ジェヒが女だと知ったウンギョルは、真剣に告白したのに正体を明かさなかったジェヒに怒りと悔しさがこみ上げる。一方、ジェヒは自分を避け続けるウンギョルを見て、これ以上テジュンを騙したくないと決心し、自分が女だとテジュンに告げる。晴れて女子となったジェヒはテジュンとデートを楽しむが、翌日、今度はウンギョルからデートを申し込まれる。ジェヒはウンギョルの真剣な想いに応える為、誘いを受ける。

ついに両想いになったジェヒとテジュンだったが、迫る全国大会に向け、テジュンが競技場近くの合宿所で過ごすことになる。「男子校に女子が潜んでいる」という噂が広まる中、ひとりぼっちのジェヒは体調を崩し、倒れてしまう。そして、駆けつけた生徒達によって遂にジェヒの正体がバレてしまう。意識を取り戻したジェヒは、テジュンには心配を掛けないようにと、この事態を伏せ、密かに転校の手続きを取る。運命の大会当日、果たしてジェヒとテジュンの恋の結末は･･･！？